Gjennom mange tiår av viktig næringsliv og aktivitet i havna har havbunnen i Svolvær havn blitt forurenset av miljøgifter. Vågan kommune har tatt initiativ og kartlagt forurensede områder og satt i gang prosjektet Renere Havn Svolvær. Prosjektet blir gjennomført i samarbeid med kommunen, Miljødirektoratet og skipsverkstedene i Svolvær. Planlagte tiltak er en kombinasjon av tildekking av havbunn med rene masser og mudring av forurensede sedimenter. Det står igjen noen undersøkelser og planlegging før tiltaket kan settes i gang. Målet er å starte tiltaket innen 5 år.
