Vågan Næringsforening er medlem av Lofoten Næringsforum, en samarbeidsorganisasjon for alle næringsforeningene i Lofoten.

Gjennom Lofoten Næringsforum er Vågan Næringsforening representert i styringsgruppen til Ungdomsprosjektet, og kompetanseutvalget til Lofotrådet.